《乱轰三国志》中，主线副本名为征伐战，是游戏PVE的核心玩法。也是主角、武将、装备等升级、强化材料的源产地。同样PVE战斗也能衡量玩家实力，试炼各式阵容，使玩家熟悉各英雄技能及玩法。
每个副本对应着一个时期的著名事件，玩家需要通过击败敌方才能前进攻击下一个目标，副本战斗是玩家升级、收集武将强化材料的主要来源。从黄巾起义开始，到张角崛起，再到十常侍乱纲，凤仪亭吕布戏貂蝉，再到刘皇叔屯兵下邳……游戏高还原三国故事情节，丝丝紧扣，再现真实的历史古战场。
游戏中，可通过点击左右箭头切换章节，向右最高只能到当前最新章节，即无法查看尚未达到的章节。尚未击败本章BOSS时，不能开启下一章。若玩家主公等级尚未达到开启下一章要求时，不能点击下一章的箭头。
主线副本推进相对简单，通关获取S级评分可积累领取丰厚的奖励，S级评分需要上阵武将在战斗胜利之后全部生存，此时一个治疗武将显得尤为关键，玩家可再前期培养中优先培养治疗武将，获取更多奖励。
